Depuis plusieurs décennies, les populations de poissons amphihalins connaissent un déclin marqué de leur abondance en France et dans le monde. Ce déclin est lié aux multiples pressions exercées sur ces espèces tout au long de leur cycle de vie, dans les milieux d‘eau douce et marin. Parmi ces pressions figurent la dégradation des habitats, le changement climatique, la surpêche et le braconnage. En 2019, la liste rouge de l’IUCN 1 en France a évalué que seules 15 % des espèces amphihalines n’étaient pas menacées ou quasi menacées ( IUCN, 2019).

Pour mieux comprendre ce déclin et proposer des mesures de gestion adaptées, il est important de pouvoir travailler sur des données de pêcheries fiables ciblant ces espèces. Une pêcherie pouvant être définie comme une unité de gestion regroupant plusieurs navires de pêches ciblant une zone géographique et/ou une espèce. Ces données permettent non seulement de caractériser les pêcheries et leurs impacts sur une espèce ou son environnement, mais aussi recueillir des informations écologiques sur l’espèce notamment dans des zones difficiles d’accès pour les suivis scientifiques, comme l’habitat en mer.

Ces dernières années, le pôle OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (pôle MIAME) a intensifié ses efforts pour collecter des données issues des pêcheries en eau douce et en mer, en particulier sur les salmonidés et l’anguille européenne. Ces actions poursuivent deux objectifs principaux : améliorer les connaissances sur ces espèces et répondre aux exigences des réglementations européennes, telles que le Data Collection Framework (DCF – encadré 1) et la directive cadre « Stratégie pour le milieu marin » (DCSMM). Grâce à son expertise reconnue, le pôle est responsable, au niveau national, de plusieurs programmes de collecte de données sur ces espèces, tant dans le cadre de ces règlements que de projets scientifiques spécifiques.

Cet article présente les protocoles et dispositifs déployés par le pôle, permettant d’avoir un processus complet de gestion des données de suivi de pêcheries, depuis leur collecte jusqu’à la transmission des résultats d’analyse.

La caractérisation des pêcheries et de leurs impacts sur une espèce ou sur l’environnement repose sur la collecte de données précises. Ces informations permettent d’évaluer l’importance des pêcheries, leur étendue géographique et leurs cibles, en prenant en compte des paramètres tels que le nombre de pêcheurs, la fréquence des sorties, les types d’engins utilisés, les zones exploitées, les espèces ciblées, ainsi que des caractéristiques biologiques comme la taille, l’âge et le sexe des individus pêchés.

Pour collecter ces données essentielles, le pôle s’appuie sur différents dispositifs et protocoles qu’il a développés en fonction des contraintes existantes et de son expertise.

En dehors des otolithes d’anguilles, gérées par le pôle de sclérochronologie d’Ifremer, tous les échantillons collectés sont gérés par le Centre de ressources biologiques Colisa ( Marchand et al., 2018) qui en assure la conservation, l’analyse, puis la mise à disposition à la communauté scientifique. Différentes analyses peuvent être réalisées sur ces échantillons pour en tirer des informations importantes sur les individus capturés. Ainsi les écailles collectées sur les salmonidés nous renseignent sur leur âge (figure 2) ( Bagliniere et al., 2020 ; Bagliniere et al., 2022) et leur sexe (par analyse moléculaire) ( Besnard et al., 2023). Pour recueillir ces mêmes informations sur l’anguille, il est nécessaire d’analyser les otolithes pour l’âge et d’observer l’appareil reproducteur pour le sexe.

Toutes les données issues directement des collectes ou des analyses des échantillons sont stockées dans différentes bases de données PosgreSQL utilisant les mêmes référentiels, permettant ainsi des connexions entre elles. La plupart de ces données respectent le principe FAIR ( Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).

Figure 2. Interprétation de l'âge d'un saumon.

L’ensemble des données et échantillons collectés pour caractériser les pêcheries et les captures sont utilisés pour améliorer la gestion des espèces, à l’échelle nationale et à l’échelle internationale.

Ainsi, le CNICS permet d’assurer le suivi des pêcheries des captures de saumons et de truites de mer réalisées par la pêche à la ligne via les télédéclarations et déclarations papier des pêcheurs professionnels. Le délai maximum de déclaration est de deux jours ouvrés pour les pêcheurs à la ligne et mensuel pour les professionnels. Ce suivi réalisé en temps réel permet, en cas d’atteinte du total autorisé de captures (TAC), d’appliquer une fermeture temporaire ou définitive de la pêche par arrêté préfectoral.

Ces données sont également utilisées pour répondre aux appels à données de la NASCO 8 ou des groupes d’experts internationaux du CIEM, Conseil international pour l'exploration de la mer, ( WGNAS 9 pour le saumon atlantique, WGTRUTTA 10 pour la truite de mer et WGEEL 11 pour l’anguille européenne). Au sein de ces groupes, les données collectées par le pôle et celles fournies par d’autres États membres permettent d’évaluer l’état des stocks de ces espèces sensibles. Les résultats des traitements des données et les évaluations produites chaque année sont publiés et servent aux différents preneurs de décision pour la mise en place de mesures de gestion. Suite à plusieurs avis du WGEEL préconisant l’arrêt de la capture d’anguilles européennes par principe de précaution, puisqu’aucun progrès global n'avait été accompli pour atteindre l'objectif de 40 % d'échappement de la biomasse d'anguilles argentées dans l'ensemble de l'Union, comme l'exige l'article 2, paragraphe 4, du règlement (CE) no 1100/2007 du Conseil (8), un nouveau règlement européen a été mis en place. Ce règlement (2023/194) a étendu à six mois la période de fermeture pour toute activité de pêche commerciale ciblant l'anguille dans les eaux marines et les eaux saumâtres de l'Union européenne de l'Atlantique du Nord-Est et de la mer Méditerranée, ainsi que pour les navires de pêche de l'Union européenne dans toutes les eaux marines de la Méditerranée. Il a également interdit toute pêche récréative de l'anguille dans ces eaux.

Dans une démarche d’amélioration continue des données transmises à ces groupes, le pôle met régulièrement en place des procédures de traitement de données. Depuis 2022, les données collectées à la criée de Saint-Jean-de-Luz ont servi à répartir les captures de la zone Adour par classe d’âge (un ou plusieurs hivers de mer) afin d'améliorer l'intégration des données françaises dans les modèles d’évaluation et ainsi faciliter la gestion des stocks.

Les données et échantillons alimentent également entre dix et quinze programmes de recherche par an. Dans le cadre du projet RENOSAUM (Rénovation de la stratégie de gestion du saumon en Bretagne) ( Prévost et Lebot, 2022), les données du CNICS (suivis des captures depuis 1987) ont permis l’élaboration d’un nouveau plan de gestion du saumon en Bretagne et contribuent à alimenter les décisions de gestion.

Les données sur l’anguille ont, elles, aussi été mobilisées lors du programme Interreg SUDOANG 12 dont l’objectif est de fournir aux gestionnaires des outils et des méthodes communes contribuant à la conservation de l’anguille européenne et de son habitat.

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Photo d’entête : V. Pagneux