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Subaquatic photogrammetry for the study of habitats in streams

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Abstract

La modification des habitats en cours d’eau est l'une des principales causes du déclin des espèces aquatiques. Cependant, la caractérisation précise, non invasive et non destructive de ces habitats est une tâche complexe et coûteuse en temps humain et matériel. Pour étudier les habitats, nous avons développé une approche innovante, non invasive et non destructive basée sur la photogrammétrie subaquatique consistant à quantifier rapidement, et de manière semi-automatique, les caractéristiques du substrat (e.g., microtopographie et taille des macro-éléments organiques ou minéraux). Nous avons réalisé des tests en milieux artificiels et naturels pour mettre au point cette technique, puis nous avons développé des descripteurs quantitatifs de l’habitat. Nous avons ensuite appliqué ce procédé à l’étude de l’écologie des larves de lamproies ou “ammocètes“. En effet, les ammocètes, potentiellement menacées par les activités humaines, ont besoin d'habitats spécifiques pour leur développement, mais les caractéristiques clés de ces habitats restent peu connues. Les résultats obtenus par photogrammétrie permettent une caractérisation millimétrique des variations de surface du substrat et apportent des éléments supplémentaires pour la compréhension de l’écologie des juvéniles de lamproie. Si des pistes d’amélioration peuvent être apportées, la photogrammétrie subaquatique est une technique prometteuse pour l’étude des habitats dans un contexte de forte anthropisation des cours d’eau.

Authors


Guillaume FORGET

guillaume.forget@inrae.fr

Affiliation : DECOD (Dynamique et Durabilité des Ecosystèmes), L'Institut Agro, IFREMER, INRAE, Rennes / Pôle Gestion des Migrateurs Amphihalins dans leur Environnement, OFB, INRAE, L'Institut Agro, UPPA, Rennes

Country : France


Alan BAZIN

Affiliation : U3E (Unité Expérimentale d'Écologie et d'Écotoxicologie aquatique), INRAE, OFB, Rennes

Country : France


Karl KREUTZENBERGER

Affiliation : Service de l’eau et des milieux aquatiques, Direction Surveillance, Evaluation, Données, OFB, U3E, Rennes / - Pôle Gestion des Migrateurs Amphihalins dans leur Environnement, OFB, INRAE, L'Institut Agro, UPPA, Rennes

Country : France


Émilien LASNE

Affiliation : DECOD (Dynamique et Durabilité des Ecosystèmes), L'Institut Agro, IFREMER, INRAE, Rennes / Pôle Gestion des Migrateurs Amphihalins dans leur Environnement, OFB, INRAE, L'Institut Agro, UPPA, Rennes

Country : France


Jean-Marc ROUSSEL

Affiliation : DECOD (Dynamique et Durabilité des Ecosystèmes), L'Institut Agro, IFREMER, INRAE, Rennes / Pôle Gestion des Migrateurs Amphihalins dans leur Environnement, OFB, INRAE, L'Institut Agro, UPPA, Rennes

Country : France


Alain CRAVE

Affiliation : Geosciences Rennes, CNRS UMR 6118, Université de Rennes 1, Rennes

Country : France


Olivier DÉZERALD

Affiliation : DECOD (Dynamique et Durabilité des Ecosystèmes), L'Institut Agro, IFREMER, INRAE, Rennes / Pôle Gestion des Migrateurs Amphihalins dans leur Environnement, OFB, INRAE, L'Institut Agro, UPPA, Rennes

Country : France

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